C'est encore trop tôt pour que Kaguya soit déjà scellée, et surtout si c'est pour laisser Zetsu en dernier ...
Kishimoto a sûrement encore des choses à nous montrer via Kaguya ( le mystère autour de son autre fils déjà ), sinon pourquoi l'avoir amenée ? Je doute que c'était le seul moyen pour faire disparaître Madara.